Altes Universitätsarchiv
Urkunden, Stiftungsakten, 1365-1869
Universitätskonsistorium/Akademischer Senat, 1377-1948
Matrikel, 1377-1917
Acta Universitatis, 1382-1513
Konsistorialakten "in genere", c. 1500-1873
Senatsakten, 1873-1948
Judizial- und Verlassenschaftsakten, 1500-1783
Sitzungsprotokolle, 1717-1938
Normalien, Patente, 1682-1848
Jüngere Stipendien- und Stiftungsakten, 1800-1948
Universitätskirche, 1778-1933
Studentenevidenz, 1793-1967
Rektorenkonferenz, 1910-1938 usw.
Studienkonseß
Akten und Protokolle, 1790-1802
Universitätsämter und Zentrale Verwaltung
Pedellenamt und Promotionskanzlei, 1704-1965
Quästur, 1783-1938
Universitätsarchiv, 1708 ff.
Universitätskassa- und Gebäudeinspektion, 1806-1872 usw.
Fakultätsarchive und Archive der Doktorenkollegien
Katholisch-theologische Fakultät, 1384-1988
Evangelisch-theologische Fakultät, 1820-1969
Rechtswissenschaftliche Fakultät, 1402-1882; 1945-1978
Medizinische Fakultät, 1399-1976
Philosophische Fakultät, 1385-1972
Formal- und Naturwissenschaftliche Fakultät, 1976-1982
Archive der Akademischen Nationen
Österreichische Nation, 1561-1881
Rheinische Nation, 1415-1881
Ungarische Nation, 1453-1881
Sächsische Nation, 1679-1850
Rheinisch-Slawische Nation, 1839-1881
Institutsarchive
Institut für Agrarpoltik, 1961-1970
Institut für Medizinische Physiologie, 1885-1975
Institut für Orientalistik, 1930-1967
Institut für Paläontologie, 1985-1989
Institut für Soziologie, 1965-1984
Institut für Theoretische Physik, 1967-1990
Josephsakademie
K. k. Medizinisch-Chirurgische Militärakademie, 1780-1889
Sonstige Archive
Wiener Internationale Hochschulkurse, 1922-1931
Volkstümliche Universitäts-Vorträge, 1896-1964
Diverse Vereinsarchive
